Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Znf280dQ68FE8 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Znf280dQ68FE8 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Znf280dQ68FE8 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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