Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Kiaa1549Q68FD9 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms