Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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