Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PtprdQ64487 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PtprdQ64487 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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PtprdQ64487 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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PtprdQ64487 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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PtprdQ64487 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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PtprdQ64487 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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PtprdQ64487 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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PtprdQ64487 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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PtprdQ64487 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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PtprdQ64487 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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PtprdQ64487 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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PtprdQ64487 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprdQ64487 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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