Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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Ccdc18Q640L5 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Ccdc18Q640L5 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Ccdc18Q640L5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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Ccdc18Q640L5 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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