Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms