Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ncor1Q60974 4933406K04Rik-201ENSMUST00000124068 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ncor1Q60974 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ncor1Q60974 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ncor1Q60974 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm40-201ENSMUST00000122131 660 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Bud31-207ENSMUST00000162594 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ncor1Q60974 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms