Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms