Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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