Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxosQ3UL53 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxosQ3UL53 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxosQ3UL53 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxosQ3UL53 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxosQ3UL53 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxosQ3UL53 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxosQ3UL53 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxosQ3UL53 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxosQ3UL53 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxosQ3UL53 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxosQ3UL53 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxosQ3UL53 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxosQ3UL53 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxosQ3UL53 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxosQ3UL53 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxosQ3UL53 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxosQ3UL53 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxosQ3UL53 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxosQ3UL53 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.5 ms