Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Tmod2-203ENSMUST00000164100 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12479-201ENSMUST00000120731 1585 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5622-201ENSMUST00000096170 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17026-201ENSMUST00000166674 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17124-201ENSMUST00000168320 1379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19337-201ENSMUST00000218100 1584 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11868-201ENSMUST00000121594 1478 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms