Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms