Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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