Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 AC158238.1-201ENSMUST00000216899 1965 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 9230112E08Rik-202ENSMUST00000189441 3352 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm15477-202ENSMUST00000143945 2351 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms