Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cers3Q1A3B0 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms