Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms