Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms