Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms