Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms