Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms