Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Col8a1Q00780 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms