Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms