Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp9bP98195 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms