Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms