Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Irx1P81068 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Irx1P81068 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Irx1P81068 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Irx1P81068 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Irx1P81068 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Irx1P81068 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Irx1P81068 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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