Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Otx2P80206 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Otx2P80206 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms