Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hoxd13P70217 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hoxd13P70217 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hoxd13P70217 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hoxd13P70217 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hoxd13P70217 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hoxd13P70217 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hoxd13P70217 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hoxd13P70217 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms