Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps28P62858 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Cndp1-201ENSMUST00000070139 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps28P62858 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Fam168a-202ENSMUST00000107042 6388 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Arhgap28-203ENSMUST00000164647 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps28P62858 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Tcf4-201ENSMUST00000066717 4250 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Phc2-203ENSMUST00000106080 3885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Tdpoz1-202ENSMUST00000181541 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Nfatc1-203ENSMUST00000167977 4604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps28P62858 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps28P62858 D930048N14Rik-201ENSMUST00000064493 3426 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Cat-201ENSMUST00000028610 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Lipa-202ENSMUST00000178114 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm18876-201ENSMUST00000219985 1849 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps28P62858 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Ap2b1-205ENSMUST00000176430 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Mink1-204ENSMUST00000102558 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Zbtb43-201ENSMUST00000028125 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Mcf2-202ENSMUST00000063507 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Drosha-201ENSMUST00000090292 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Akr1c19-202ENSMUST00000118663 5832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Mboat2-202ENSMUST00000110942 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 AC116589.5-201ENSMUST00000222230 1660 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm21026-201ENSMUST00000218628 1345 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Ank3-237ENSMUST00000183074 4948 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Sez6l2-202ENSMUST00000106333 3595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Stat1-206ENSMUST00000186857 4241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Zfp946-201ENSMUST00000088763 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm37522-201ENSMUST00000195437 2884 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm13651-201ENSMUST00000119086 1110 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm9273-201ENSMUST00000200606 715 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Olfr709-ps1-201ENSMUST00000072368 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Cald1-202ENSMUST00000079391 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Tnr-201ENSMUST00000111669 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Zfp658-202ENSMUST00000107972 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gpr85-203ENSMUST00000115492 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Limk2-202ENSMUST00000101640 3711 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Nell1-202ENSMUST00000107603 2756 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Ppip5k1-203ENSMUST00000110626 5171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Ankrd55-201ENSMUST00000022275 2412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Tcaim-201ENSMUST00000052740 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Kif18b-201ENSMUST00000021311 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Nupl1-202ENSMUST00000041905 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm43366-201ENSMUST00000199829 2655 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rps28P62858 AC136986.2-201ENSMUST00000220880 2944 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Rps28P62858 Mc3r-201ENSMUST00000038532 2623 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rps28P62858 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Rps28P62858 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rps28P62858 Adam1a-201ENSMUST00000100757 3496 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rps28P62858 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
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