Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Strn4P58404 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Strn4P58404 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Strn4P58404 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Strn4P58404 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Strn4P58404 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Strn4P58404 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Strn4P58404 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Strn4P58404 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Strn4P58404 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Strn4P58404 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Strn4P58404 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Strn4P58404 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Strn4P58404 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms