Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fgf9P54130 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms