Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TgfaP48030 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms