Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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