Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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