Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp2P29594 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casp2P29594 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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