Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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