Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa5P28312 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms