Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
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