Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms