Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TP20293 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TP20293 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TP20293 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TP20293 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
TP20293 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TP20293 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TP20293 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TP20293 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
TP20293 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
TP20293 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
TP20293 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TP20293 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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