Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms