Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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