Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms