Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Pear1-216ENSMUST00000174759 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Olfr169-203ENSMUST00000215476 2476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms