Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
OtcP11725 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtcP11725 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtcP11725 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtcP11725 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtcP11725 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtcP11725 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtcP11725 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtcP11725 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtcP11725 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtcP11725 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtcP11725 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
OtcP11725 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtcP11725 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtcP11725 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtcP11725 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtcP11725 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
OtcP11725 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtcP11725 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtcP11725 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms