Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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H2-Eb1P04230 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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H2-Eb1P04230 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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H2-Eb1P04230 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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H2-Eb1P04230 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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H2-Eb1P04230 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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H2-Eb1P04230 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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