Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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