Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms