Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms