Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms