Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
XntrpcF8VQM8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms